В редакторе отчетов можно сформировать выписку по операциям для конкретного контрагента из НДС.
В книге покупок (Раздел 8) и книге продаж (Раздел 9) в верхней навигационной панели таблицы сведений из книг нажмите кнопку Сформировать выписку:

Затем заполните ИНН контрагента, по которому нужна выписка. Нажмите кнопку Сформировать:

Выписка будет сформирована в формате PDF.