Если у иностранного гражданина нет отчества, то действует временное ограничение - УНЭП можно выпустить только через кадровую службу. Подробнее в статье Подтверждение выпуска УНЭП через кадровую службу (лично).

В остальном процесс выпуска подписи такой же, как для резидентов РФ.