Для выбора сертификата УЦ ФНС в окне мастера создания заявления на подключение в поле Сертификат эл.подписи нажмите Выбрать:

Выберите место хранения сертификата и нажмите кнопку ОК:

В открывшемся окне Сертификаты укажите требуемый сертификат и нажмите кнопку Выбрать:

Выбранный сертификат отобразится в соответствующем поле.

Завершите отправку заявления.